Họ endonuclease/exonuclease/phosphatase
Giao diện
Họ endonuclease/exonuclease/phosphatase | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Cấu trúc của enzyme sửa chữa DNA đa chức năng exonuclease III.[1] | |||||||||
Danh pháp | |||||||||
Ký hiệu | Exo_endo_phos | ||||||||
Pfam | PF03372 | ||||||||
InterPro | IPR005135 | ||||||||
PROSITE | PDOC00598 | ||||||||
SCOP | 1ako | ||||||||
OPM family | 139 | ||||||||
OPM protein | 1zwx | ||||||||
CDD | cd08372 | ||||||||
|
Họ endonuclease/exonuclease/phosphatase là vùng cấu trúc được tìm thấy trong một họ protein lớn bao gồm enzyme endonuclease phụ thuộc magnesi và nhiều phosphatase tham gia hoạt động tín hiệu nội bào.[2]
Ví dụ
[sửa | sửa mã nguồn]- AP endonuclease protein EC 4.2.99.18
- DNase I protein EC 3.1.21.1
- Synaptojanin, một loại inositol-1,4,5-trisphosphate phosphatase EC 3.1.3.56
- Sphingomyelinase EC 3.1.4.12
- Nocturnin, một loại NADPH 2' phosphatase[3]
Phân họ
[sửa | sửa mã nguồn]- Inositol polyphosphate related phosphatase (Phosphatase liên quan inositol polyphosphate) InterPro: IPR000300
Protein người chứa vùng này
[sửa | sửa mã nguồn]2'-PDE; 2-PDE; ANGEL1; ANGEL2; APEX1; APEX2; CCRN4L; CNOT6; CNOT6L; DNASE1; DNASE1L1; DNASE1L2; DNASE1L3; INPP5A; INPP5B; INPP5D; INPP5E; INPPL1; KIAA1706; OCRL; PIB5PA; SKIP; SMPD2; SMPD3; SYNJ1; SYNJ2; TTRAP; Nocturnin;
Chú thích
[sửa | sửa mã nguồn]- ^ Mol CD, Kuo CF, Thayer MM, Cunningham RP, Tainer JA (tháng 3 năm 1995). “Structure and function of the multifunctional DNA-repair enzyme exonuclease III”. Nature. 374 (6520): 381–6. doi:10.1038/374381a0. PMID 7885481.
- ^ Dlaki M (2000). “Functionally unrelated signalling proteins contain a fold similar to Mg2+-dependent endonucleases”. Trends Biochem. Sci. 25 (6): 272–273. doi:10.1016/S0968-0004(00)01582-6. PMID 10838565.
- ^ Estrella MA, Du J, Chen L, Rath S, Prangley E, Chitrakar A, Aoki T, Schedl P, Rabinowitz J, Korennykh A (tháng 5 năm 2019). “The metabolites NADP+ and NADPH are the targets of the circadian protein Nocturnin (Curled)”. Nature Communications. 10 (1): 2367. doi:10.1038/s41467-019-10125-z. PMC 6542800. PMID 31147539. Tóm lược dễ hiểu – Science Daily.
Tham khảo
[sửa | sửa mã nguồn]- Dlakić M (tháng 6 năm 2000). “Functionally unrelated signalling proteins contain a fold similar to Mg2+-dependent endonucleases”. Trends Biochem. Sci. 25 (6): 272–3. doi:10.1016/S0968-0004(00)01582-6. PMID 10838565.
- Mol CD, Kuo CF, Thayer MM, Cunningham RP, Tainer JA (tháng 3 năm 1995). “Structure and function of the multifunctional DNA-repair enzyme exonuclease III”. Nature. 374 (6520): 381–6. doi:10.1038/374381a0. PMID 7885481.
- Lahm A, Suck D (tháng 12 năm 1991). “DNase I-induced DNA conformation. 2 A structure of a DNase I-octamer complex”. J. Mol. Biol. 222 (3): 645–67. doi:10.1016/0022-2836(91)90502-W. PMID 1748997.