Embecovirus
Giao diện
Embecovirus | |
---|---|
Phân loại virus | |
(kph): | Virus |
Vực: | Riboviria |
Ngành: | incertae sedis |
Bộ: | Nidovirales |
Họ: | Coronaviridae |
Chi: | Betacoronavirus |
Phân chi: | Embecovirus |
Species[1] | |
Embecovirus là một phân chi của coronavirus trong chi Betacoronavirus.[2] Các virut trong phân chi này, không giống như các coronavirus khác, có gen hemagglutinin esterase (HE).[3] Các virut trong thế hệ con trước đây được gọi là coronavirus nhóm 2a.[4][5]
Cấu trúc
[sửa | sửa mã nguồn]Các virut của phân chi này, giống như các coronavirus khác, có lớp màng bọc lipid trong đó các protein cấu trúc màng (M), vỏ (E) và gai (S) được neo lại.[6] Không giống như các coronavirus khác, virus trong thế hệ con này cũng có một protein cấu trúc giống như gai ngắn hơn gọi là hemagglutinin esterase (HE).[3][7]
Xem thêm
[sửa | sửa mã nguồn]- Sarbecovirus (nhóm 2b)
- Merbecovirus (nhóm 2c)
- Nobecovirus (nhóm 2d)
Tham khảo
[sửa | sửa mã nguồn]- ^ “Virus Taxonomy: 2018 Release” (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (bằng tiếng Anh). tháng 10 năm 2018. Lưu trữ bản gốc ngày 4 tháng 3 năm 2018. Truy cập ngày 24 tháng 1 năm 2019.
- ^ “Virus Taxonomy: 2018 Release”. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (bằng tiếng Anh). tháng 10 năm 2018. Bản gốc (html) lưu trữ ngày 4 tháng 3 năm 2018. Truy cập ngày 24 tháng 1 năm 2019.
- ^ a b Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (ngày 24 tháng 8 năm 2010). “Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis”. Viruses. 2 (8): 1804–1820. doi:10.3390/v2081803. ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708.
In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
- ^ Woo, Patrick C. Y.; Wang, Ming; Lau, Susanna K. P.; Xu, Huifang; Poon, Rosana W. S.; Guo, Rongtong; Wong, Beatrice H. L.; Gao, Kai; Tsoi, Hoi-wah (tháng 2 năm 2007). “Comparative Analysis of Twelve Genomes of Three Novel Group 2c and Group 2d Coronaviruses Reveals Unique Group and Subgroup Features”. Journal of Virology. 81 (4): 1574–1585. doi:10.1128/JVI.02182-06. ISSN 0022-538X. PMC 1797546. PMID 17121802.
See figure 2.
- ^ Wong, Antonio C. P.; Li, Xin; Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y. (ngày 20 tháng 2 năm 2019). “Global Epidemiology of Bat Coronaviruses”. Viruses. 11 (2): 174. doi:10.3390/v11020174. ISSN 1999-4915. PMC 6409556. PMID 30791586.
CoVs are classified into four genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus and Deltacoronavirus. Within Betacoronavirus, they can be further subclassified into lineages A, B, C and D [1]. In 2018, these four lineages were reclassified as subgenera of Betacoronavirus, and renamed as Embecovirus (previous lineage A), Sarbecovirus (previous lineage B), Merbecovirus (previous lineage C) and Nobecovirus (previous lineage D) [2]. In addition, a fifth subgenus, Hibecovirus, was also included (Figure 1) [2].
- ^ The Molecular Biology of Coronaviruses; III. Structure of Virions; A. Virion Morphology (bằng tiếng Anh)
- ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (ngày 24 tháng 8 năm 2010). “Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis”. Viruses. 2 (8): 1804–1820. doi:10.3390/v2081803. ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708.
The presence of HE genes exclusively in members of Betacoronavirus subgroup A, but not members of Betacoronavirus subgroup B, C and D suggested that the recombination had probably occurred in the ancestor of members of Betacoronavirus subgroup A, after diverging from the ancestor of other subgroups of Betacoronavirus.