Psymberin
| Psymberin | |
|---|---|
 | |
| Danh pháp IUPAC | (2S,3S)-N-((S)-((2S,4R,6R)-6-((2S,3R)-3-((R)-6,8-dihydroxy-5-methyl-1-oxoisochroman-3-yl)-2-hydroxybutyl)-4-hydroxy-5,5-dimethyltetrahydro-2H-pyran-2-yl)(methoxy)methyl)-2-hydroxy-3-methoxy-5-methylhex-5-enamide |
| Tên khác | irciniastatin A |
| Nhận dạng | |
| Số CAS | |
| ChEMBL | |
| Ảnh Jmol-3D | ảnh |
| SMILES | đầy đủ
|
| Thuộc tính | |
| Công thức phân tử | C31H47NO11 |
| Khối lượng mol | 609.71 g/mol |
| Bề ngoài | chất rắn trong suốt[1] |
| Điểm nóng chảy | |
| Điểm sôi | |
| Các nguy hiểm | |
Trừ khi có ghi chú khác, dữ liệu được cung cấp cho các vật liệu trong trạng thái tiêu chuẩn của chúng (ở 25 °C [77 °F], 100 kPa). | |
Psymberin, cũng được biết đến với tên gọi irciniastatin A, là một độc tố tế bào có nguồn gốc từ động vật thân lỗ ở biển. Nó được khám phá bởi hai nhóm nghiên cứu độc lập vào năm 2004.[1][2] Psymberin có hoạt tính sinh học cao, liều gây chết trung bình (LC50) với nồng độ ở mức nano phân tử có thể phá hủy các loại khối u khác nhau.[1][2]
Sinh tổng hợp[sửa | sửa mã nguồn]
Quá trình sinh tổng hợp psymberin trở nên được quan tâm vì nó có cấu trúc rất giống với pederin, một sản phẩm tự nhiên có nguồn gốc từ chi bọ cánh cứng Paederus.[3] Điều này khiến cho các nhà nghiên cứu phải tìm ra các gen của sinh vật đã mã hóa việc tạo ra chất này. Một cụm tổng hợp polyketid trans-AT, được xếp vào cụm Psy, có chứa hai nhóm gen lớn mã hóa cho hai PKS.[3] Nhóm gen nhỏ hơn, psyA, mã hóa một PKS với ba modul (domain), trong khi nhóm psyD lớn hơn mã hóa mười module PKS. Protein có mười module PsyD này, cho đến nay, là protein với số module PKS cao nhất đã từng ghi nhận.[3] Những đoạn lớn của cụm gen psyD rất giống với những đoạn tương ứng trong cụm gen mã hóa pederin. Điều này cho thấy rằng psymberin và pederin có tương quan cả về cấu trúc lẫn sinh tổng hợp. Hình dưới đây cho thấy quá trình tổng hợp sinh học của psymberin dựa trên phân tích các cụm gen. Số La Mã đại diện cho nhánh nào thuộc về Ketosynthase nào. Các domain được viền đỏ thể hiện là các protein vận chuyển. Các chữ viết tắt tương ứng với hình bên dưới: GNAT, GCN5-related N-acetyltransferase; CR, crotonase; KR, ketoreductase; KS0, non-elongating ketoreductase; OMT, O-methyltranfserase; C, nonribosomal peptide synthetase (NRPS) condensation domain; A, NRPS adenylation domain; MT, Methyltransferase; DH, deydratase; TE, Thioesterase; ?, unknown.
Đọc thêm[sửa | sửa mã nguồn]
Chú thích[sửa | sửa mã nguồn]
- ^ a b c Cichewicz RH, Valeriote FA, Crews P (2004). “Psymberin, a potent sponge-derived cytotoxin from Psammocinia distantly related to the pederin family”. Org. Lett. 6 (12): 1951–4. doi:10.1021/ol049503q. PMID 15176791.
- ^ a b Pettit GR, Xu JP, Chapuis JC, Pettit RK, Tackett LP, Doubek DL, Hooper JN, Schmidt JM (2004). “Antineoplastic agents. 520. Isolation and structure of irciniastatins A and B from the Indo-Pacific marine sponge Ircinia ramosa”. J. Med. Chem. 47 (5): 1149–52. doi:10.1021/jm030207d. PMID 14971894.
- ^ a b c Fisch KM, Gurgui C, Heycke N, van der Sar SA, Anderson SA, Webb VL, Taudien S, Platzer M, Rubio BK, Robinson SJ, Crews P, Piel J (2009). “Polyketide assembly lines of uncultivated sponge symbionts from structure-based gene targeting”. Nat. Chem. Biol. 5 (7): 494–501. doi:10.1038/nchembio.176. PMID 19448639.