Phường (9): Đồng Tâm · Hồng Hà · Hợp Minh · Minh Tân · Nam Cường · Nguyễn Phúc · Nguyễn Thái Học · Yên Ninh · Yên Thịnh Xã (6): Âu Lâu · Giới Phiên · Minh Bảo · Tân Thịnh · Tuy Lộc · Văn Phú
Phường (4): Cầu Thia · Pú Trạng · Tân An · Trung Tâm Xã (10): Hạnh Sơn · Nghĩa An · Nghĩa Lộ · Nghĩa Lợi · Nghĩa Phúc · Phù Nham · Phúc Sơn · Sơn A · Thạch Lương · Thanh Lương
Thị trấn (1): Yên Thế (huyện lỵ) Xã (23): An Lạc · An Phú · Động Quan · Khai Trung · Khánh Hòa · Khánh Thiện · Lâm Thượng · Liễu Đô · Mai Sơn · Minh Chuẩn · Minh Tiến · Minh Xuân · Mường Lai · Phan Thanh · Phúc Lợi · Tân Lập · Tân Lĩnh · Tân Phượng · Tô Mậu · Trúc Lâu · Trung Tâm · Vĩnh Lạc · Yên Thắng
Thị trấn (1): Mù Cang Chải (huyện lỵ) Xã (13): Cao Phạ · Chế Cu Nha · Chế Tạo · Dế Xu Phình · Hồ Bốn · Khao Mang · Kim Nọi · La Pán Tẩn · Lao Chải · Mồ Dề · Nậm Có · Nậm Khắt · Púng Luông
Thị trấn (1): Trạm Tấu (huyện lỵ) Xã (10): Bản Công · Bản Mù · Hát Lừu · Làng Nhì · Pá Hu · Pá Lau · Phình Hồ · Tà Si Láng · Trạm Tấu · Túc Đán · Xà Hồ
Thị trấn (1): Cổ Phúc (huyện lỵ) Xã (20): Báo Đáp · Bảo Hưng · Cường Thịnh · Đào Thịnh · Hòa Cuông · Hồng Ca · Hưng Khánh · Hưng Thịnh · Kiên Thành · Lương Thịnh · Minh Quán · Minh Quân · Nga Quán · Quy Mông · Tân Đồng · Vân Hội · Việt Cường · Việt Hồng · Việt Thành · Y Can
Thị trấn (3): Sơn Thịnh (huyện lỵ) · Nông trường Liên Sơn · Nông trường Trần Phú Xã (21): An Lương · Bình Thuận · Cát Thịnh · Chấn Thịnh · Đại Lịch · Đồng Khê · Gia Hội · Minh An · Nậm Búng · Nậm Lành · Nậm Mười · Nghĩa Sơn · Nghĩa Tâm · Sơn Lương · Sùng Đô · Suối Bu · Suối Giàng · Suối Quyền · Tân Thịnh · Thượng Bằng La · Tú Lệ
Thị trấn (1): Mậu A (huyện lỵ) Xã (24): An Bình · An Thịnh · Châu Quế Hạ · Châu Quế Thượng · Đại Phác · Đại Sơn · Đông An · Đông Cuông · Lang Thíp · Lâm Giang · Mậu Đông · Mỏ Vàng · Nà Hẩu · Ngòi A · Phong Dụ Hạ · Phong Dụ Thượng · Quang Minh · Tân Hợp · Viễn Sơn · Xuân Ái · Xuân Tầm · Yên Hợp · Yên Phú · Yên Thái
Thị trấn (1): Yên Bình (huyện lỵ) · Thác Bà Xã (22): Bạch Hà · Bảo Ái · Cảm Ân · Cảm Nhân · Đại Đồng · Đại Minh · Hán Đà · Mông Sơn · Mỹ Gia · Ngọc Chấn · Phú Thịnh · Phúc An · Phúc Ninh · Tân Hương · Tân Nguyên · Thịnh Hưng · Vĩnh Kiên · Vũ Linh · Xuân Lai · Xuân Long · Yên Bình · Yên Thành