Giải bóng đá U17 Quốc gia Việt Nam 2006 có tên gọi chính thức là Giải bóng đá U17 Quốc gia Việt Nam - Cúp Báo Bóng Đá 2006 là mùa giải thứ 3 do VFF tổ chức. Giải đấu này diễn ra theo hai giai đoạn, các trận đấu tại vòng loại sẽ diễn ra từ ngày 18/6 đến ngày 14/7/2006. Sau khi kết thúc vòng loại, 8 đội lọt vào Vòng chung kết sẽ tranh tài từ 24/7 đến 4/8/2006. Sân chơi U17 Quốc gia thực sự là cơ hội tăng cường thi đấu có sát cho lớp cầu thủ kế cận của các đội bóng và có ý nghĩa rất phù hợp với chiến lược phát triển chung của bóng đá châu lục và thế giới. Những gương mặt tài năng mới xuất hiện tại giải này, cùng với các cầu thủ tại giải lứa tuổi 19 quốc gia, sẽ là nguồn bổ sung và thay thế lý tưởng cho đội tuyển U20 để chuẩn bị cho Vòng chung kết giải vô địch U20 Đông Nam Á và châu Á sắp tới.[1][2]
20 đội bóng đủ tiêu chuẩn tham dự vòng loại, Ban tổ chức giải chia thành 3 bảng dựa theo khu vực địa lý như sau:
Bảng A do Nam Định làm bảng trưởng, gồm 7 đội: Nam Định, Hà Nội, Hà Tĩnh, Quảng Ninh, Thể Công, Trung tâm bóng đá Hải Phòng và VST.
Bảng B do Đà Nẵng làm bảng trưởng, gồm 6 đội: Đà Nẵng, Bình Định, Bình Thuận, Ninh Thuận, Quảng Nam và Quảng Ngãi.
Bảng C do Trung tâm TDTT Thành Long làm bảng trưởng, gồm 7 đội: Thành Long, Cần Thơ, Đồng Nai, Đồng Tháp, Kiên Giang, TPHCM và Khánh Hòa.
Các trận đấu tại vòng loại sẽ diễn ra từ ngày 18/6 đến ngày 14/7/2006. Sau khi kết thúc vòng loại, 8 đội lọt vào Vòng chung kết sẽ tranh tài từ 24/7 đến 4/8/2006. Đội vô địch sẽ nhận Cúp, Cờ, Huy chương vàng và giải thưởng 40 triệu đồng. Ngoài giải Nhì, 2 giải Ba và giải Phong cách, Ban tổ chức còn quyết định trao các giải thưởng phụ nhằm tôn vinh và khích lệ các cá nhân xuất sắc như giải thưởng dành cho Cầu thủ ghi nhiều bàn thắng nhất Vòng chung kết, Cầu thủ xuất sắc nhất Vòng chung kết, Thủ môn xuất sắc nhất Vòng chung kết và Trọng tài xuất sắc nhất Vòng chung kết.[3]
Vòng loại giải bóng đá Quốc gia U17- Cúp báo Bóng Đá đã chính thức khép lại sau gần một tháng tranh tài của tổng cộng 20 đội bóng thuộc 3 bảng A, B và C. Các trận đấu đã diễn ra rất sôi động và giàu tính cạnh tranh bởi mỗi bảng chỉ chọn ra 2 đại diện ưu tú nhất để góp mặt tại Vòng chung kết cùng Đương kim vô địch Sông Lam Nghệ An và chủ nhà An Giang.
Tại bảng A do Sở TDTT Nam Định làm bảng trưởng, Nam Định và Thể Công đã xuất sắc đoạt vé vào Vòng chung kết.
Tại bảng B do Sở TDTT Đà Nẵng làm bảng trưởng, quyền đi tiếp được trao cho Đà Nẵng và Quảng Ngãi.
Tại bảng C do TTTDTT Thành Long làm bảng trưởng, Đồng Tháp và Thành Long chiếm 2 vị trí dẫn đầu và ghi tên vào danh sách 8 đội tại Vòng chung kết.[4][5]
Sân vận động Long Xuyên (An Giang) là nơi tổ chức Vòng chung kết giải bóng đá lứa tuổi U17 Quốc gia - Cúp báo Bóng đá 2006, diễn ra từ ngày 24/7 đến ngày 4/8/2006. Với sự góp mặt của 8 đội bóng tham dự: Thể Công Viettel, GM.M.Nam Định, P.SLNA, Quảng Ngãi, Đà Nẵng, Thành Long, Đồng Tháp, chủ nhà An Giang.[6]